最近,首届上海外洋预料生物学立异大赛·药物筛选AI算法“凌越”挑战赛完成初评J9九游会,86支参赛团队用东谈主工智能(AI)算法研发的约1000个分子插足湿践诺阶段,中国科学院上海药物磋商所原立异药磋商宇宙重心践诺室将通过细胞践诺,考据这些分子的活性,为抑郁症、阿尔茨海默病、癫痫、难过等神经系统疾病的新药发现奠定基础。
举办这项大赛,是上海市科委“以赛选项”的立异举措,合适条目的获奖团队将直遴选入上海市科技立异行动沟通“预料生物学”专项,得到后续支握,将前沿科技后果转动为新质坐褥力。
将AI算法对准神经疾病靶点
预料生物学是一门哄骗预料机时代磋商生物学的交叉学科,预料生物学践诺也称为干践诺,传统的生物学践诺则叫作湿践诺。连年来,跟着东谈主工智能时代的兴起,这门学科已毕了向上式发展。比如,谷歌旗下DeepMind公司斥地的“阿尔法折叠2”(AlphaFold 2)东谈主工智能系统在外洋卵白质三维结构斟酌竞赛上夺冠,其斟酌精度在某些方面格外接近湿践诺测定水平,被好意思国《科学》杂志评为2020年十大科学冲突之一。
在医药行业,东谈主工智能算法可援救药物筛选的种种性、有用性和遵守,让更多的原立异药在预料生物学干践诺中出生。“药物发现的一个紧要阶梯是高通量筛选化合物,由于传统生物学高通量筛选的试剂耗材资本高、周期长、操作复杂等成分,要发现原立异药,靠近很大挑战。”中国科学院上海分院副院长、中国科学院上海药物磋商所原立异药磋商宇宙重心践诺室主任高召兵说,“AI算法应用在这个规模,能快速地从几十万个化合物中筛选出潜在活性分子,为生物学湿践诺的药物发现提供泉源分子,对新药研发具有紧要好奇。”
首届上海外洋预料生物学立异大赛前年12月入手
正因为好奇紧要,市科委制定了《上海市预料生物学立异发展行动沟通(2023—2025年)》,并成就了上海市科技立异行动沟通“预料生物学”专项。前年12月,在市科委带领下,上海市生物医药科技发展中心支配的首届上海外洋预料生物学立异大赛·药物筛选AI算法“凌越”挑战赛入手,以NMDA(N-甲基-D-天冬氨酸)离子通谈为靶标,邀请人人5东谈主以下团队和个东谈主报名参赛,哄骗华为云提供的算力发现小分子妥洽剂。大赛结果将在2024年浦江立异论坛上揭晓。
对神经系统疾病而言,离子通谈是仅次于G卵白偶联受体的第二大成药靶点。算作一类振奋性离子型谷氨酸通谈,NMDA参与大脑突触信号传递,具有调控学习追思和神经系统发育等功能。其功能格外与抑郁症、阿尔茨海默病、精神差别症等多种疾病密切关联。“赛题以NMDA通谈家眷中尚未被充分磋商的GluN1/GluN3A亚型为磋商假想,但愿通过参赛团队的立异决议和湿践诺考据,获取高活性、高弃取性的小分子妥洽剂。”高召兵说。
探索以赛选项、以赛选东谈主机制
上海市生物医药科技发展中心主任李积宗先容,本届大赛预料报名1329东谈主,共组团队342支。其中,汉文页面报名1316东谈主,英文页面报名13东谈主。他们共提交了180份立异决议概要,进程内行组评审,产生113份有用概要。大赛为通过概要评审的团队提供了总价值30万元的华为云代金券,让参赛选手哄骗这些算力资源,用AI算法筛选出能与NMDA通谈GluN1/GluN3A亚型蛊卦的候选小分子药物。
结果,86支参赛团队共筛选出约1000个分子。除了2支团队提交了自行合成的分子,大多半分子来自赛事支配方和协办方(皓元医药)提供的化合物数据库。
这些分子中,哪些有望成为立异药?当今,中国科学院上海药物磋商所厚爱的湿践诺考据责任已入手。湿践诺包括细胞水平践诺和动物体内践诺,为限度经费和时辰资本,大赛考据责任只作念细胞践诺,旨在测试AI算法假想的分子有多大活性。活性越高,假想这个分子的团队获奖可能性越大。把柄规则,合适条目的获奖团队将得到预料生物学专项支握。在专项经费的资助下,他们可开展动物践诺,把AI辅助磋商后果向候选药物研发阶段鞭策。
“这是一次以赛选项、以赛选东谈主的机制探索。”李积宗示意,大赛排行主要把柄湿践诺考据结果排定,因此与传统评审神情比较,“以赛选项”更客不雅。通过举办大赛,还有望在人人范围内彩选预料生物学东谈主才,已毕“以赛选东谈主”。据统计,通过初评的86支团队中,来自恃校的团队有60支,企业团队有17支,另有9支团队未走漏所属单元类型。从地域漫衍看,这些团队来自北京、上海、江苏、浙江、安徽等15个省区市和澳门尽头行政区,另有12支团队未走漏地方地区。
除了财政经费,市科委和大赛支配方还将为获奖团队对接资金、科研和产业资源。本届大赛的蚁集支配单元中,就有中国银行上海市分行、东方好意思谷企业集团、上海大宁钞票沟通集团等机构,它们能为获奖团队后续研发和产业化提供有劲支握。
首届上海外洋预料生物学立异大赛的基本信息J9九游会